Pod Bazyliką św. Piotra znajdują się tzw. Groty Watykańskie. Są to pomieszczenia, które powstały w wyniku podwyższenia poziomu bazyliki w XVI wieku i zajmują przestrzeń między podłogą starej bazyliki konstantyńskiej a nowej świątyni barokowej. Składają się one z prostokątnej sali podzielonej pilastrami na 3 nawy oraz z półokrągłego obejścia otaczającego grób Piotra Apostoła. Właśnie w tym obejściu, obok grobu Piusa XII, ks. Alfons Skotniecki, proboszcz polskiej parafii w Three Rivers (USA), ufundował polską kaplicę dedykowaną Matce Boskiej Częstochowskiej (1958 r.). Kaplica ta przez wiele lat służyła Polakom odwiedzającym Wieczne Miasto, lecz po wyborze Karola Wojtyły na papieża liczba polskich pielgrzymów odwiedzających ten polski zakątek przy grobie św. Piotra zwiększyła się znacznie i kaplica nie była w stanie ich pomieścić (miała zaledwie 30 m2 powierzchni).
Przebudowy dokonano w związku z 600-leciem Sanktuarium Jasnogórskiego. Jan Paweł II inaugurował odnowioną i powiększoną Kaplicę Polską w 1982 r. Obecnie jest ona w formie trapezu szerszego przy absydzie i ma 80 m2.. Jest wyłożona czerwonym marmurem z Werony. Ołtarz w Kaplicy składa się z dwóch kapiteli i mensy, która spoczywała kiedyś na ołtarzu Piusa X, w jego wnętrzu znajdują się relikwie polskich świętych: Wojciecha, Stanisława Biskupa, Stanisława Kostki, Jadwigi, Jana z Kęt, Kazimierza, Jacka i Andrzeja Boboli. Kamienne rzeźby dłuta M. Paszyny przedstawiające wymienionych świętych umieszczono przy ścianach bocznych. Absyda udekorowana jest płaskorzeźbami czterech Ewangelistów, pochodzącymi z tabernakulum Innocentego VIII, oraz marmurową aediculą z mozaikową ikoną Matki Boskiej Częstochowskiej, autorstwa Anny Torwirtowej.
Rano 2 kwietnia w Kaplicy Polskiej odbyła się wzruszająca ceremonia: w czasie uroczystej Mszy św. kard. Marian Jaworski ukoronował wizerunek Matki Boskiej Częstochowskiej z Dzieciątkiem Jezus złotymi koronami papieskimi.
Jan Paweł II od dłuższego czasu pragnął podziękować Matce Bożej za opiekę nad Kościołem i ojczyzną. Okazją stała się 350. rocznica obrony Jasnej Góry przed potopem szwedzkim. Ojciec Święty zlecił wykonanie dwóch par koron: jedna przeznaczona była dla Sanktuarium Jasnogórskiego, druga - dla Kaplicy Polskiej, w której również tronuje wizerunek Matki Narodu z Dzieciątkiem. Korony pobłogosławił 1 kwietnia 2005 r., w przeddzień swojej śmierci. Fakt ten sprawia, że uroczystość koronacji urasta do rangi symbolu. Symbolem jest również wybór celebransa - Metropolita Lwowski obrządku łacińskiego jest następcą bł. Józefa Bilczewskiego, który na początku XX wieku wypraszał u św. Piusa X i otrzymał w 1910 r. drugie korony dla Jasnogórskiego Wizerunku (pierwsze zostały skradzione). Poza tym warto przypomnieć, że śluby Jana Kazimierza miały miejsce we Lwowie 1 kwietnia. Z kard. Jaworskim Mszę św. koncelebrowali m.in.: przeor Jasnej Góry - o. Marian Lubelski, o. Kamil Szustak i o. Albert Szustak.
1 kwietnia 2005 r. Ojciec Święty podpisał list z okazji jubileuszu 350-lecia cudownej obrony Jasnej Góry skierowany na ręce o. Izydora Matuszewskiego - generała Zakonu Paulinów. Obok publikujemy w całości ten ostatni list Papieża Jana Pawła II skierowany dla Jasnej Góry.