Archidiecezja krakowska zdobywa środki finansowe jedynie ze składek wiernych. Są nimi ofiary złożone na tacę w polskich kościołach, a także składki partycypacyjne rejestrujących się pielgrzymów i wolontariuszy. Każdy z uczestników, tak jak było to na poprzednich ŚDM, bierze udział w pokryciu kosztów organizacji.

Do tej pory w kościołach przeprowadzono dwie takie składki, a dwie kolejne odbędą się 15 listopada i 15 maja. Ofiary zbierane w polskich parafiach nie wystarczą, stąd konieczność, aby pielgrzymi, zgodnie z decyzją Papieskiej Rady ds. Świeckich, partycypowali solidarnie w pokryciu kosztów organizacji ŚDM przez przekazanie ustalonej składki przy okazji rejestracji swojego uczestnictwa - informuje Komitet Organizacyjny ŚDM.

W zamian za rejestrację i składkę pielgrzymi mogą skorzystać z usług, takich jak zakwaterowanie, wyżywienie, transport z miejsc zakwaterowania na wydarzenia centralne, ubezpieczenie i plecak pielgrzyma. Są trzy poziomy składek partycypacyjnych, określone przez Komitet Organizacyjny ŚDM Kraków 2016 i zatwierdzone przez Papieską Radę ds. Świeckich.

Podkreślić należy, że składki partycypacyjne są dobrowolne, a wydarzenia Światowych Dni Młodzieży będą otwarte i bezpłatne dla wszystkich chętnych.

Każdy zarejestrowany uczestnik ŚDM otrzyma także Plecak Pielgrzyma, czyli zestaw publikacji i materiałów duszpastersko-identyfikacyjnych, pomagających w dobrym przeżyciu uroczystości, komunikowaniu się po mieście, itp.

W kosztach organizacji ŚDM uczestniczyć będą także wolontariusz. Również oni mogą zadeklarować chęć skorzystania z noclegu lub wyżywienia. Wszyscy wolontariusze będą mieli zagwarantowany transport, ubezpieczenie oraz identyfikujący ich plecak i koszulkę.

Koszty ponoszone przez miasto to koszty bieżące i inwestycyjne (według szacunków odpowiednio 80 i 55 milionów). Niektóre z inwestycji były wcześniej przewidywane w budżetach, a zostały przyspieszone ze względu na przyszłoroczną wizytę Ojca Świętego. Kościół bierze na siebie finansowanie miejsc celebracji, a więc organizację sektorów, projekty i budowę tych przestrzeni, nagłośnienie, oświetlenie, projekty i budowę ołtarzy. Archidiecezja finansuje również m.in. ornaty, mitry, puszki do rozdawania Komunii.

Jak stwierdził organizator ŚDM, ze względu na złożoność wydarzenia i wielowątkowość przygotowań, dziś trudno określić całościowe koszty ŚDM. Szacunki strony kościelnej opierają się na doświadczeniu ŚDM Madryt 2011.

Sama organizacja tego wydarzenia mieści się w zakresie działalności pożytku publicznego, co uzasadnione jest działalnością kościelnej osoby prawnej, o której mowa w art. 16 ustawy z dania 17 maja 1999 roku o stosunku Państwa do Kościoła katolickiego. Jest to zatem działalność kultu publicznego, rozumianego w tym wypadku jako organizacja imprezy o charakterze religijnym.

W kwestiach podziału kompetencji między Miastem a Gminą Kraków, Województwem Małopolskim oraz stroną rządową a Kościołem stwierdzono, że przygotowanie ŚDM jest zadaniem archidiecezji krakowskiej i powołanej do tego celu jednostki, jaką jest Komitet Organizacyjny ŚDM Kraków 2016.