Fabio Fabene urodził się 12 marca 1959 roku w Rzymie. Święcenia kapłańskie przyjął 26 maja 1984 i został włączony do duchowieństwa diecezji Montefiascone. Uzyskał doktorat z prawa kanonicznego na Papieskim Uniwersytecie Laterańskim. Był kanclerzem diecezji Viterbo i wykładowcą prawa kanonicznego na tamtejszym Instytucie Teologicznym św. Piotra. Od 1998 roku pracował w Kongregacji ds. Biskupów. 8 lutego 214 roku Ojciec Święty mianował go podsekretarzem Synodu Biskupów. 8 kwietnia 2014 papież Franciszek podniósł go do godności biskupa tytularnego Aquipendium]. Sakry udzielił mu 30 maja 2014 osobiście papież Franciszek.

28 lutego 2017 został mianowany biskupem tytularnym Mons Faliscus. W Kongregacji Spraw Kanonizacyjnych bp Fabene zastąpi liczącego niemal 77 lat abp. Marcello Bartolucciego.