W pisemnym sprawozdaniu GIODO wspomniał o istniejącej do niedawna niejednolitości orzecznictwa sądów administracyjnych dotyczących ochrony danych osobowych w przypadkach apostazji.

Jak wskazał, „początkowo w ocenie NSA Generalny Inspektor powinien ustalać kwestie uaktualnienia danych osobowych apostatów na gruncie przepisów powszechnie obowiązujących, natomiast według aktualnego stanowiska NSA Generalny Inspektor winien powyższe sprawy rozstrzygać zgodnie z przepisami wewnętrznymi kościoła”.

W środę na posiedzeniu sejmowej komisji sprawiedliwości i praw człowieka dr Edyta Bielak-Jomaa, generalna inspektor ochrony danych osobowych tłumaczyła, że GIODO „od początku swej działalności, otrzymując skargi osób, które chciały wystąpić z Kościoła katolickiego, stał na stanowisku, że nie jest kompetentny do oceny tego, czy dana osoba jest czy nie jest członkiem Kościoła katolickiego, ponieważ ta ocena dokonywana być powinna w oparciu o prawo wewnętrzne Kościoła katolickiego”.

Na skutek późniejszych apelacji - przypomniała dr Bielak-Jomaa - NSA zmienił jednak linię orzeczniczą, uznając, że GIODO ma "obowiązek dokonywania kontroli tego, czy dana osoba skutecznie wystąpiła z Kościoła katolickiego". GIODO uznał wówczas, że do takiego skutecznego wystąpienia wystarczy oświadczenie woli.

W lutym br. NSA ostatecznie uznał, że apostazja może być dokonana jedynie według wewnętrznych kościelnych procedur. Sąd oddalił wtedy sześć skarg GIODO przeciwko proboszczom w sprawie odmowy odnotowania w księgach chrztu wystąpienia z Kościoła katolickiego. Proboszczowie parafii we Wrocławiu, Bukowinie Tatrzańskiej, Kołobrzegu, Mikołowie, Międzyrzeczu i Pietrowicach Wielkich odmówili w 2013 r. wpisania do ksiąg chrztu adnotacji w sprawie wystąpienia z Kościoła na podstawie art. 60 kodeksu cywilnego (tzw. oświadczenie woli).

Proboszczowie wskazywali występującym o taką adnotację, jakie wymogi należy spełnić w przypadku wystąpienia z Kościoła katolickiego. W pierwszej kolejności należy uzyskać metrykę chrztu, potem udać się do proboszcza parafii miejsca zamieszkania, aby porozmawiać na temat wystąpienia. Następnie wobec proboszcza i dwóch świadków złożyć oświadczenie woli wraz z podpisem. Na tej podstawie zostaje sporządzony dokument, który jest przesyłany do Kurii, która następnie wydaje zalecenie dotyczące wpisu w księdze chrztów. Wówczas wydawane jest świadectwo chrztu z adnotacją o apostazji.

Osoby dokonujące apostazji złożyły na tę procedurę skargę do GIODO, żądając, by urząd wystąpił o sprostowanie ich nieaktualnych danych na podstawie art. 32 ustawy o ochronie danych osobowych. NSA oddalił jednak skargi GIODO. - Mamy do czynienia z konstytucyjnym prawem do wyznania, GIODO nie może oceniać, jakie jest nasze wyznanie - wyjaśniła wyrok sędzia Joanna Rudnicka. - Z drugiej strony Kościół ma zagwarantowane prawa w Konstytucji RP i Konkordacie ze Stolicą Apostolską. Z tych regulacji wynika rozdział Kościoła od państwa - dodała sędzia Rudnicka.

W 2015 r. GIODO przyjął 73 skargi zawierające „zarzut nielegalnego przetwarzania danych osobowych przez proboszczów parafii Kościoła Katolickiego”. W tymże roku urząd wydał łącznie 120 decyzji w sprawach dotyczących Kościoła katolickiego, z czego 73 razy nakazywał przywrócenie stanu zgodnego z prawem, 7 razy umarzał postępowanie, w 5 przypadkach odmawiał uwzględniania wniosku. W 35 sprawach podtrzymał zaskarżoną decyzję po złożonym wniosku o ponowne rozpatrzenie sprawy zakończonej decyzją administracyjną.